本書概述了傳染病信息學框架、體系和相關技術基礎，詳細闡述了傳染病時空數(shù)據(jù)分析，傳播動力學模型方法，復雜網(wǎng)絡中傳染病傳播建模的原理、方法和應用。在傳染病監(jiān)測預警方法基礎上，結合生物信息學及互聯(lián)網(wǎng)大數(shù)據(jù)等方面的發(fā)展，重點介紹了基于基因組學和互聯(lián)網(wǎng)大數(shù)據(jù)的傳染病信息學研究進展及相關預測預警新技術，并在傳染病監(jiān)測技術基礎上進一步介紹了傳染病信息學在維護全球生物安全以及擴展應用到生物監(jiān)測的有關情況，最后總結了傳染病信息學當前面臨的主要挑戰(zhàn)以及在全球化時代傳染病信息學2.0的發(fā)展方向。
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目錄
第1章 概論 1
1.1 導言 1
1.2 概述 3
第2章 傳染病信息學技術基礎 9
2.1 傳染病的流行強度 9
2.2 傳染病流行的三種基本特征 10
2.3 傳染病信息學技術方法的框架結構 12
2.4 傳染病信息學的時空數(shù)據(jù)分析方法 16
2.5 傳染病信息學分析的操作流程 18
第3章 傳染病監(jiān)測數(shù)據(jù)的空間分析 23
3.1 疫區(qū)范圍的幾何特征分析 23
3.2 空間相關性分析 26
3.3 點模式分析 31
3.4 空間回歸分析 33
第4章 傳染病動力學模型 37
4.1 經(jīng)典SIR模型 37
4.2 SEIR模型的改進 45
4.3 案例分析：2003年廣州市SARS流行 50
第5章 基于復雜網(wǎng)絡的傳染病傳播模型 57
5.1 復雜網(wǎng)絡模型 57
5.2 基于復雜網(wǎng)絡模型的傳染病防控研究 63
5.3 小結 70
第6章 傳統(tǒng)傳染病監(jiān)測預警技術 74
6.1 傳染病監(jiān)測預警探測算法 74
6.2 相關案例：ESSENCE Ⅱ 82
6.3 小結 87
第7章 新型傳染病監(jiān)測預警技術 90
7.1 基于基因組學的傳染病溯源與預測預警技術 90
7.2 基于互聯(lián)網(wǎng)大數(shù)據(jù)的傳染病監(jiān)測預警技術 103
第8章 全球生物安全與生物監(jiān)測 119
8.1 導言 119
8.2 生物安全威脅及其對國家安全的影響 120
8.3 全球生物安全監(jiān)測策略 124
8.4 當前生物監(jiān)測面臨的挑戰(zhàn) 128
8.5 建立高效全球生物監(jiān)測系統(tǒng) 130
8.6 全球生物監(jiān)測系統(tǒng)的展望 132
8.7 小結 133
第9章 傳染病信息學面臨的挑戰(zhàn)與發(fā)展方向 137
9.1 傳染病信息學1.0與傳染病信息學2.0 139
9.2 傳染病信息學1.0面臨的挑戰(zhàn) 140
9.3 傳染病信息學2.0的發(fā)展方向 142
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