第1章 基因組學(xué)概述
1．1 基因組學(xué)的定義和分類(lèi)
1．2 基因組學(xué)的歷史回顧和挑戰(zhàn)
1．3 基因組學(xué)的研究范圍和方法
1．4 微生物功能基因組學(xué)的重要性

第2章 基因功能預(yù)測(cè)的計(jì)算方法
2．1 基因功能推斷的方法
2．2 從基因序列到功能
2．3 以結(jié)構(gòu)為基礎(chǔ)的功能預(yù)測(cè)
2．4 在系統(tǒng)水平上的功能推斷
2．5 非同源的方法進(jìn)行功能推斷

第3章 微陣列基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)分析
3．1 微陣列基因表達(dá)數(shù)據(jù)的歸一化
3．2 微陣列基因表達(dá)譜結(jié)果分析
3．3 共表達(dá)基因的識(shí)別
3．4 差異表達(dá)基因的識(shí)別
3．5 基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析在途徑推理中的應(yīng)用

第4章 病原細(xì)菌的生物危害及其耐藥性
4．1 病原細(xì)菌與細(xì)菌性疾病
4．2 病原細(xì)菌的生物危害及防護(hù)對(duì)策
4．3 細(xì)菌的分泌系統(tǒng)
4．4 病原細(xì)菌的耐藥性
4．5 抗菌藥物的分類(lèi)及作用機(jī)制

第5章 研究細(xì)菌致病機(jī)制的動(dòng)物模型
5．1 哺乳動(dòng)物感染模型
5．2 非哺乳類(lèi)脊椎動(dòng)物感染模型：斑馬魚(yú)
5．3 無(wú)脊椎動(dòng)物感染模型：秀麗隱桿線(xiàn)蟲(chóng)和其他線(xiàn)蟲(chóng)
5．4 昆蟲(chóng)感染模型
5．5 植物感染模型
5．6 細(xì)胞感染模型

第6章 病原細(xì)菌致病基因組研究策略
6．1 病原細(xì)菌基因組研究進(jìn)展
6．2 病原細(xì)菌比較基因組學(xué)研究策略
6．3 功能基因組學(xué)研究策略
6．4 細(xì)菌致病有關(guān)的基因決定簇

第7章 研究病原細(xì)菌基因功能的新方法
7．1 體內(nèi)表達(dá)技術(shù)及其應(yīng)用
7．2 重組工程及其在細(xì)菌遺傳學(xué)中的應(yīng)用
7．3 蛋白質(zhì)組學(xué)在研究病原微生物基因功能中的應(yīng)用

第8章 細(xì)菌入侵細(xì)胞的主要機(jī)制
8．1 細(xì)菌進(jìn)入宿主細(xì)胞的機(jī)制
8．2 細(xì)菌在細(xì)胞質(zhì)中的作用機(jī)制
8．3 細(xì)菌在囊泡中的作用機(jī)制

第9章 細(xì)菌對(duì)宿主防御系統(tǒng)的免疫逃避機(jī)制
9．1 細(xì)菌對(duì)宿主營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的利用：以銅綠假單胞菌的研究為例
9．2 細(xì)菌逃避補(bǔ)體系統(tǒng)
9．3 細(xì)菌對(duì)抗菌肽的抗性
9．4 細(xì)菌誘導(dǎo)宿主細(xì)胞死亡
參考文獻(xiàn)